A tárolási infrastruktúra és a megfelelő IT rendszer elengedhetetlen a jó biobank működéséhez
Az alábbiakban a már megszokott három fő típust hasonlítjuk össze különböző szemopontok alapján. Tárolási és infrastruktúrális igénye minden rendszernek más kiépítést igényel.
Informatikai rendszere szintén mindegyiknek más, hiszen más és más adatokkal dolgozik, tehát más lesz adatkezelési és nyilvántartási követelménye.
Ezért az összehasonlítás alapjának az adatbázis kezelést, a nyomon követési rendszert (LIMS-Laboratóriumi Inforációkezelő Rendszer) és a biztonsági követelményeket vettük.
Tárolási és infrastruktúrális szempontok
A tárolási szempontoknál figyelembe kell venni, hogy milyen típusú hűtőberendezésünk van.
Választhatunk a -80°C-os fagyasztóból, a folyékony nitrogénes (LN₂) hűtésből illetve lehetőség van az automatizált hűtési rendszerek igénybevételére is.
-80°C-os fagyasztó
Folyékony nitrogénes tárolás (LN₂)
Automatizált tároló rendszer
Felhasználás célja
Első sorban rövid távon használják, klinikai és kutatási célokra.
Hosszú távú terveknél használják, pl. a genetikai mintatárolás esetén.
Általában hosszú távú célokra alkalmazzák, pl. nagy volumenű minták rendszerezett és gyors hozzáférésére.
Tárolási módszer
Mechanikus fagyasztó berendezés.
Folyékony nitrogén vagy gőzfázis használata.
Szinte teljesen robotizált helység.
Helyigény
A fagyasztók számától függően a kevés és közepes helyigényű berendezések közé tartozik. Több fagyasztó is lehet egymás mellett.
Több helyet igényel, a szigeteléssel ellátott tartályok között biztonsági távolságot kell tartani.
Több helyigényű, mert az automatizált rendszerek is helyet foglalnak.
Hőmérséklet-ingadozási érzékenység
Opcionális használat mellett minimális ingadozás, közepesen stabil hőtartás
Minimális ingadozás, stabil hőtartás
Szenzorokkal szabályozott, stabil hőtartás
Hibaelhárítás lehetősége
Gyakori karbantartás mellett a mechanikus meghibásodások és cserék könnyen megoldhatóak
Opcionális használat mellett a nitrogén ellátás könnyen megoldható.
Rendszeres ellenőrzés mellett a karbantartás és javítás könnyen megvalósítható
Minta nyomon követése, adatbázis integráció
Manuális illetve félautomata nyilvántartás is lehetséges.
Manuális illetve elektronikus rendszerrel kombinált megoldás áll rendelkezésre
Teljesen automatizált, LIMS teljes integrációja megvalósítható.
Informatikai rendszerek
Szempont
Klinikai biobank
Genetikai biobank
Diagnosztikai biobank
Adatbázis kezelése
Klinikai adatbázis integráció (pl. kórházi rendszerekkel)
Genetikai információkat tartalmazó adatbázisok (pl. genomikai adatok)
Diagnosztikai képek, patológiai jelentések és szövetminták adatbázisas
Nyomon követési rendszer (LIMS)
Mintakövető és betegadat-nyilvántartó rendszer
Speciális genetikai LIMS rendszerek (pl. molekuláris szekvenálás támogatása)
Minták és laborvizsgálatok eredményeinek nyomon követése
Biztonsági követelmények
Fizikai és digitális biztonsági protokollok
Adatok anonimizálása, genomikai titkosítás
Adatvédelmi követelmények a betegjogok védelme érdekében
A fenti szempontokból látható, hogy milyen tárolási igényeknek kell megfelelni és milyen informatikai rendszerekre (adatbázis és nyilvántartó rendszer) van szükség egy biobank üzemeltetéséhez. Ez egy rövidebb összefoglaló, bővebben a megvalósíthatósági menüpont alatt olvashattok róla.
Illetve, ha kérdés merülne fel kérdezzetek minket és lehetőleg 24 órán belül válaszunk.