Minta típusok és gyűjtési módok
A biobank (civil nevén a mintabank) létrehozása során jelentős eltérések találhatóak a felhasználásukat illetően. Felhasználásuknak 3 fő típusa ismeretes (ettől eltérő is lehet), a klinikai, a genetikai és a diagnosztikai.
A biobankok többféle mintát is gyűjtenek, a leggyakoribb minta típusok a következők:
- Vér: A leggyakoribb és legsokoldalúbb minta típus, amelyet rutinszerűen gyűjtenek. A vérből nyerhető szérum, plazma, fehérvérsejtek és genetikai anyag.
- Szövetminta: Leggyakrabban biopsziával vagy műtéti úton gyűjtik. A szövetmintákat általában folyékony nitrogénben vagy alacsony hőmérsékleten, speciális fagyasztóban tárolják, hogy megőrizzék biológiai tulajdonságaikat.
- Nyál: A nyál mintavétel egyszerű és nem invazív módja a DNS kinyerésének genetikai vizsgálatokhoz.
- Vizelet és széklet: Ezek a minták a gyulladásos bélbetegségek, a bélflóra és az anyagcsere-betegségek kutatására szolgálnak.
- Csontvelő: A csontvelő mintákat hematológiai betegségek, például a leukémia kutatására használják.
A mintagyűjtési protokollok szigorú szabványok szerint zajlanak, és minden mintát egyedi azonosítóval látnak el a követhetőség érdekében. A minták tárolása általában fagyasztott állapotban történik, jellemzően -80°C-on vagy folyékony nitrogénben, hogy megőrizzék biológiai tulajdonságaikat.
Az egyszerűség kedvéért összeszedtük azokat a szempontokat, amelyekben ez a 3 fő terület eltérhet egymástól.
Szempont
Klinikai Biobank
Genetikai Biobank
Diagnosztikai Biobank
Milyen mintákat tárol?
Vér, szérum, plazma, szövetminták, vizelet, cerebrospinális folyadék
DNS, RNS, sejtvonalak, teljes vér, szövetek
Biopsziás minták, patológiai metszetek, citológiai minták
Gyűjtés módja
Kórházakban és klinikai kutatások során
Speciális genetikai mintavétel, családi és populációs adatokkal kiegészítve
Kórházak, patológiai intézetek, orvosi diagnosztikai laborok
Mintatárolás jellemzői
Hűtött vagy fagyasztott tárolás (-20°C, -80°C)
DNS: -20°C vagy -80°C, RNS: -80°C vagy folyékony nitrogén
Gyakran formalin-fixált, paraffinba ágyazott (FFPE) valamint -80°C-on fagyasztott minták